Az intézet ügyvitelének minden évi közvetlen és kötelező kontrollját az Állami Számvevőszékről szóló törvény határozza meg. Az Állami Számvevőszék minden évben ténylegesen is ellenőrzi az intézet pénzügyi és egyéb ügyvitelét.
A törvény értelmében a munkaügyekért felelős miniszter felügyeli az intézet működésének törvényességét, illetve az eszközök célszerű használatát. Amennyiben a munkaügyekért felelős miniszter szabálytalanságokat állapít meg, határozatban dönt a szabálytalanságok megszüntetésének határidejéről és az ehhez szükséges beavatkozásokról.
A munkaügyekért felelős miniszter visszatarthatja az intézet tanácsának döntését, amennyiben ez véleménye szerint törvénytelen, nincs összhangban az intézet pénzügyi tervével vagy az állami költségvetéssel. A döntéséről köteles értesíteni a Kormányt.
A Szlovén Országgyűlés és a Szlovén Köztársaság Kormánya közvetett felügyelettel rendelkezik az intézet eszközeinek tervezése és felhasználása felelett, ezt az intézet minden évi pénzügyi tervének Kormány általi jóváhagyásának intézménye biztosítja.